Varianta p.Val66Met v genu pro mozkový neurotrofní faktor (BDNF) v české populaci
Single Nucleotide Polymorphism p.Val66Met in BDNF Gene in the Czech Population
Aim:
To determine the allele frequency of the p.Val66Met (rs6265) polymorphism in BDNF gene (brain-derived neurotrophic factor, BDNF) in the Czech population. The p.Val66Met (rs6265) polymorphism in the BDNF gene is associated with impaired intracellular trafficking and secretion of BDNF. Alterations in BDNF expression and function are involved in different brain disorders and represent a major downstream mechanism for stress response.
Material and methods:
Retrospectively, 317 DNA control samples of Czech individuals aged between 45 and 81 years (173 men and 144 women), were examined for p.Val66Met polymorphism in the BDNF gene using the melting analysis.
Results:
Frequency of the mutant allele (A) was 16.3% and it was 83.7% for the wild type allele (G).
Conclusion:
The requency of the p.Val66Met polymorphism in the BDNF gene in the Czech population was determined.
Key words:
brain-derived neurotrophic factor (BDNF) – single nucleotide polymorphism – genotype – Czech population
The authors declare they have no potential conflicts of interest concerning drugs, products, or services used in the study.
The Editorial Board declares that the manuscript met the ICMJE “uniform requirements” for biomedical papers.
Chinese summary - 摘要
捷克人口BDNF基因的单核苷酸多态性p.Val66Met目标:
为了确定捷克人口的BDNF基因(脑源性神经营养因子,脑源性神经营养因子)中p.Val66Met(rs6265)多态性的等位基因频率。BDNF基因中的p.Val66Met(rs6265)多态性与受损的细胞内运输和BDNF的分泌有关。BDNF表达和功能的改变涉及不同的脑疾病,并且是应激反应的主要下游机制。
材料和方法:
使用融合分析方法,回顾性分析了317例45〜81岁捷克人(173例男性,144例女性)的DNA对照样本,检测其BDNF基因中的p.Val66Met多态性。
结果:
突变等位基因(A)的频率为16.3%,野生型等位基因(G)为83.7%。
结论:
确定了捷克人口BDNF基因中的p.Val66Met多态性的频率。
关键词:
脑源性神经营养因子(BDNF) - 单核苷酸多态性 - 基因型 - 捷克人口
Authors:
S. Walczysková 1; P. Ressner 2; Š. Hilscherová 1
Authors‘ workplace:
Laboratoř DNA diagnostiky, oddělení lékařské genetiky, FN Ostrava
1; Ambulance pro extrapyramidová onemocněni a kognitivni poruchy, Neurologická klinika, LF OU a FN Ostrava
2
Published in:
Cesk Slov Neurol N 2017; 80/113(5): 597-600
Category:
Short Communication
doi:
https://doi.org/10.14735/amcsnn2017597
Overview
Cíl:
Stanovení alelové frekvence polymorfizmu p.Val66Met (rs6265) v genu pro mozkový neurotrofní faktor (brain-derived neurotrophic factor; BDNF) v české populaci. Přítomnost polymorfizmu p.Val66Met v genu BDNF je spojována s porušeným intracelulárním transportem a sekrecí BDNF. Změny v expresi a funkci BDNF jsou spojeny s různými onemocněními mozku a představují jeden z mechanizmů odpovědi na stres.
Soubor a metodika:
Retrospektivně bylo v kontrolní skupině vyšetřeno 317 vzorků DNA jedinců z české populace (173 mužů a 144 žen) ve věku 45–81 let. Polymorfizmus p.Val66Met v genu BDNF byl vyšetřen analýzou křivek tání.
Výsledky:
Frekvence mutantní alely (A) v kontrolní skupině činila 16,3 %; frekvence standardní alely (G) činila 83,7 %.
Závěr:
Byla stanovena frekvence polymorfizmu p.Val66Met v genu BDNF, která je srovnatelná s frekvencemi v okolních zemích.
Klíčová slova:
mozkový neurotrofní faktor (BDNF) – jednonukleotidový polymorfizmus – genotyp – česká populace
Úvod
Jedním z důležitých faktorů v procesu učení a tvorby paměti je mozkový neurotrofní faktor BDNF (brain-derived neurotrofic factor), jenž reguluje plasticitu synapsí, růst axonů, proliferaci dendritů a diferenciaci neuronů. Má také vliv na kognici, chování, odpověď na stres aj. [1– 3]. BDNF je kódován genem, který je uložen na krátkém raménku chromozomu 11 v oblasti 11p13. Změny v hladině tohoto neurotrofního faktoru, většinou jeho snížení, jsou spojovány s kognitivním deficitem. BDNF prostupuje hematoencefalickou bariérou [4], jeho hladina v plazmě může odrážet hladinu BDNF v centrálním nervovém systému, a tím případně vyjadřovat míru mentálního deficitu a stupeň degenerace mozkové tkáně [5]. BDNF má rovněž vliv na klíčové neurotransmiterové systémy: dopaminergní, glutaminergní a serotonergní [6]. V genu BDNF bylo popsáno množství polymorfizmů. Jedním z nejčastěji studovaných jednonukleotidových polymorfizmů je c.196G > A (rs6265), způsobený záměnou aminokyseliny valinu v kodónu 66 za methionin (p.Val66Met). Dává tak vznik třem možným genotypům (Val/Val, Val/Met, Met/Met). Frekvence jeho mutantní alely (A) se liší od téměř nulové frekvence v Africe až po 54 % v Asii a takřka 20% frekvenci v kavkazské populaci (údaje z finské, britské – Anglie a Skotsko a iberské populace ve Španělsku plus z oblasti Toskánska) (1,000 genome project). Význam jednonukleotidového polymorfizmu p.Val66Met v genu BDNF je široce studován v souvislosti s mnoha stavy, jako jsou např. vnímavost vůči migréně [7], závislost na heroinu [8], u psychiatrických onemocnění (zvláště u úzkosti a deprese, schizofrenie, panické poruchy, posttraumatické stresové poruchy (PTSD)) [3,9,10], u obezity pacientů trpících bipolární poruchou [11], u Rettovy choroby, Alzheimerovy choroby, Huntingtonovy choroby aj.
V in vitro experimentech na kultivovaných neuronech hippokampu provedených autory Egan et al byla mutantní alela (A) sledovaného jednonukleotidového polymorfizmu spojována s nižší expresí BDNF [2].
Snížení hladiny BDNF u pacientů s depresivní poruchou však mohou způsobovat environmentální vlivy, jako je např. stres [1,3]. Ve studii autorů Lang et al byla zjištěna souvislost mezi koncentraci BDNF v séru a genotypem p.Val66Met, kdy standardní alela (G) byla spojována spíše s nižší hladinou BDNF v séru u zdravých jedinců. Pacienti s depresivní poruchou, nižší hladinou sérového BDNF a genotypem Val/ Val mohou být více vnímaví k rozvoji příznaků deprese. Mohou však pozitivně reagovat na léčbu antidepresivy zvýšením hladiny BDNF [12]. Novější longitudinální studie autorů Bus et al, která sledovala změny v hladině BDNF v séru pacientů s chronickou depresivní poruchou a v kontrolní skupině, naznačuje nejen, že BDNF se podílí na depresi, ale také projevy deprese se mohou podílet na snížení hladiny BDNF [13]. Další čtyřletá studie autorů Ihara et al ukazuje, že hladiny BDNF v séru měřené u skupiny pacientů s depresivní poruchou (a dalších poruch spojených se změnami nálady) nejsou nižší v porovnání se skupinou s depresivními epizodami. Dlouhodobě snížené hladiny BDNF v séru u pacientů s depresivní poruchou jsou spíše příznakem stavu (state marker) než rysem poruchy (trait marker) a je možné, že jeho hladiny se snižují několik měsíců před rozvojem depresivní poruchy [14]. U jedinců s PTSD byla zjištěna podstatně vyšší frekvence genotypů Met/Met a Val/Met než u jedinců bez PTSD. Frekvence mutantní alely (A) byla dvojnásobná (33,3 vs. 17,5 %) [15]. Studie podporující status jednonukleotidového polymorfizmu p.Val66Met v genu BDNF jako rizikového faktoru pro PTSD jsou popsány v pracích autorů Bruenig et al nebo Pivac et al [10,16]. Mozkový neurotrofní faktor byl navržen jako možný biomarker rizika vzniku PTSD, autoři uvádí jeho ochranný efekt standardní alely při zvýšené expozici stresu [15]. Naopak dřívější studie autorů Zhang et al nenašla spojitost mezi variantami v genu BDNF (vč. p.Val66Met) a PTSD, Alzheimerovou chorobou nebo schizofrenií [17]. Je možné, že hladiny BDNF v séru ovlivňují i jiné faktory než přítomnost deprese [18]. Kromě toho nebyl vždy ke kontrolním studiím vybrán konzistentní soubor jedinců ze stejné populace, jako byla populace pacientů, přičemž rozdíly v alelové frekvenci mezi populacemi ukazují na specificitu etnik [14,19].
Materiál a metody
Jednonukleotidový polymorfizmus p.Val66Met (c.196G > A) v genu BDNF byl vyšetřen analýzou křivek tání na přístroji LightCycler 480 II (Roche) pomocí fluorescenčně značených sond (TIB MOLBIOL) viz obr. 1. Stanovení genotypu pro zmíněný jednonukleotidový polymorfizmus bylo provedeno retrospektivně ve skupině 317 kontrolních vzorků DNA české populace (173 mužů a 144 žen) ve věku 45– 81 let (věkový průměr mužů 66 let, věkový průměr žen 68 let).
Výsledky
Frekvence mutantní alely (A) v kontrolní skupině činila 16,3 %; frekvence standardní alely (G) činila 83,7 %, souhrnné výsledky zobrazuje tab. 1.
Diskuze
Předmětem této studie bylo stanovení frekvence jednonukleotidového polymorfizmu p.Val66Met v genu BDNF ve vzorku české populace.
Rozpory ve zjištěných hladinách BDNF v rámci různých studií mohou být způsobeny rozdílnými metodami měření nebo právě v rozdílech ve zkoumaných vzorcích populace [5,19]. V literatuře dosud chyběly studie mapující frekvenci jednonukleotidového polymorfizmu p.Val66Met v české populaci. Zjištěná frekvence mutantní alely (A) 16,3 % v české populaci se blíží frekvenci v britské (16 %) a finské populaci (17 %). V polské populaci byla stanovena frekvence 17 % [20]. Zajímavá je 18% frekvence popsaná v populaci Telugu, Indů žijících v Anglii (1,000 genome project). Migrace této populace do Evropy není v odborné literatuře popsána. Jedná se o Indy mluvící jazykem telugu (třetím nejčastějším úředním jazykem v Indii), kteří v 80. letech 20. století masivně migrovali nejvíce do USA nebo Kanady jako studenti nebo IT pracovníci.
V odborné literatuře převládají studie, které nezjistily významnou korelaci mezi variantami BDNF (p.Val66Met) a hladinou BDNF v plazmě [21,22]. Vyšetření ke stanovení hladiny BDNF v krvi není v České republice běžně dostupné. Zatím se provádí v rámci výzkumných projektů jako možný marker predikce neurodegenerativních onemocnění.
Četné studie se rozcházejí v přínosu sledování polymorfizmu p.Val66Met v genu BDNF, hlavně u pacientů s depresí, nicméně novější studie autorů Colle et al popisují negativní vliv genotypu výše uvedeného polymorfizmu na odpověď na různé typy antidepresiv (SSRI a SNRI/TCA) a poukazuje tak na možnost personalizované léčb [23].
Ukazuje se, že analýza genu BDNF může být velmi slibná v diagnostice a predikci vyjádření některých symptomů u vybraných neurodegenerativních onemocnění. Ve starší práci autorů Nectoux et al je zajímavá zmínka o polymorfizmu p.Val66Met v BDNF genu, který může predikovat, zda dojde či nedojde k časnému výskytu epileptických záchvatů u pacientů s Rettovým syndromem [24].
Závěr
Polymorfizmus p.Val66Met v genu BDNF ukazuje na možnost ovlivnění spektra symptomatického vyjádření, tedy fenotypového obrazu Rettova syndromu, ale i u některých výše uvedených neurologických a psychiatrických nozologických jednotek, kde je tento polymorfizmus studován. Jednoznačná doporučení pro vyšetření sledovaného polymorfizmu v genu BNDF v běžné klinické praxi zatím nejsou dostupná, ale již probíhající studie a recentní výsledky jsou slibné v možném otevření nových cest, jak chápat polymorfizmus některých, zejména neurodegenerativních, onemocnění. Jako pravděpodobná se ukazuje nová možnost personalizované léčby některých onemocnění, jež by zvýšila účinnost již dostupné léčby. Slibně to dokládají data u pacientů s depresí o odpovědi na léčbu různými typy antidepresiv v závislosti na polymorfizmu p.Val66Met v genu BDNF [23].
Tato dílčí práce vznikla ve Fakultní nemocnici Ostrava v rámci projektu RVO-FNOs/2013 podpořeného z prostředků Institucionální podpory na dlouhodobý koncepční rozvoj výzkumné organizace.
Autoři deklarují, že v souvislosti s předmětem studie nemají žádné komerční zájmy.
Redakční rada potvrzuje, že rukopis práce splnil ICMJE kritéria pro publikace zasílané do biomedicínských časopisů.
RNDr. Sylwia Walczysková
Oddělení lékařské genetiky FN Ostrava
17. listopadu 1790/5
708 52 Ostrava
e-mail: sylwia.walczyskova@fno.cz
Přijato k recenzi: 11. 5. 2017
Přijato do tisku: 27. 7. 2017
Sources
1. Duman RS, Menteggia LM. A neurotrophic model for stress-related mood disorders. Biol Psychiatry 2006;59:1116– 27.
2. Egan MF, Kojima M, Callicott JH, et al. The BDNF val66met Polymorphism Affects Activity-Dependent Secretion of BDNF and Human Memory and Hippocampal Function. Cell 2003;112:257– 69.
3. Begni V, Riva MA, Cattaneo A. Cellular and molecular mechanisms of the brain-derived neurotrophic factor in physiological and pathological conditions. Clin Sci (Lond) 2016;131(2):123– 138. doi: 10.1042/ CS20160009.
4. Pan W, Banks WA, Fasold MB, et al. Transport of brain-derived neurotrophic factor Gross the blood-brain barrier. Neuropharmacology 1998;37(12):1553– 61.
5. Chen SL, Lee SY, Chang YH, et al. The BDNF Val66Met polymorphism and plasma brain-derived neurotroph-ic factor levels in Han Chinese patients with bipolar disorder and schizophrenia. Prog Neuropsychopharmacol Biol Psychiatry 2014;51:99– 104. doi: 10.1016/ j.pnpbp.2014.01.012.
6. Mandelman SD, Grigorenko EL. BDNF Val66Met and cognition: all, none, or some? A meta-analysis of the genetic association. Genes Brain Behav 2012;11(2):127– 36. doi: 10.1111/ j.1601-183X.2011.00738.x.
7. Coskun S, Varol S, Ozdemir HH, et al. Association of brain-derived neurotrophic factor and nerve growth factor gene polymorphisms with susceptibility to migraine. Neuropsychiatr Dis Treat 2016;19(12):1779– 85. doi: 10.2147/ NDT.S108814.
8. Jin T, Zhang H, Yang Q, et al. The relationship between polymorphisms of BDNFOS and BDNF genes and heroin addiction in the Han Chinese population. J Gene Med 2016;18(10):288– 293. doi: 10.1002/ jgm.2927.
9. Chen K, Wang N, Zhang J, et al. Is the Val66Met polymorphism of the brain-derived neurotrophic factor gene associated with panic disorder? A meta-analysis. Asia Pac Psychiatry 2015;9(2):e12228. doi:10.1111/ appy.12228.
10. Bruenig D, Lurie J, Morris CP, et al. A Case-Control Study and Meta-Analysis Reveal BDNF Val66MetIs a Possible Risk Factor for PTSD. Neural Plast 2016;2016:6979435. doi: 10.1155/ 2016/ 6979435.
11. Morales-Marín ME, Genis-Mendoza AD, Tovilla-Zarate CA, et al. Association between obesity and the brain-derived neurotrophic factor gene polymorphism Val66Met in individuals with bipolar disorder in Mexican population. Neuropsychiatr Dis Treat 2016;25(12):1843– 8. doi: 10.2147/ NDT.S104654.
12. Lang UE, Hellweg R, Sander T, et al. The Met allele of the BDNF Val66Met polymorphism is associated with increased BDNF serum concentrations. Mol Psychiatry 2009;14(2):120– 2. doi: 10.1038/ mp.2008.80.
13. Bus BA, Moledijk ML, Tendolkar I, et al. Chronic depression is associated with a pronounced decrease in serum brain-derived neurotrophic factor over time. Mol Psychiatry 2015;20(5):602– 8. doi:10.1038/ mp.2014.83.
14. Ihara K, Yoshida H, Jones PB, et al. Serum BDNF levels before and after the development of mood disorders: a case- control study in a population kohort. Transl Psychiatry 2016;6:e782. doi: 10.1038/ tp.2016.47.
15. Zhang L, Li X, Hu XZ. Post-traumatic stress disorder risk and brain-derived neurotrophic factor Val66Met. World J Psychiatr 2016;6(1):1– 6. doi:10.5498/ wjp.v6.i1.1
16. Pivac N, Nikolac M, Nedic M, et al. Brain derived neurotrophic factor Val66Met polymorphism and psychotic symptoms in Alzheimer‘s disease. Prog Neuropsychopharmacol Biol Psychiatry 2011;35(2):356– 62.
17. Zhang H, Ozbay F, Lappalainen J, et al. Brain derived neurotrophic factor (BDNF) gene variants and Alzheimer’s disease, affective disorders, posttraumatic stress disorder, schizophrenia, and substance dependence. Am J Med Genet B Neuropsychiatr Genet 2006;141B:387– 93. doi: 10.1002/ ajmg.b.30332.
18. Elfving B, Buttenschøn HN, Foldager L, et al. Depression, the Val66Met polymorphism, age, and gender influence the serum BDNF level. J Psychiatr Res 2012;46(9):1118– 25. doi: 10.1016/ j.jpsychires.2012.05.003.
19. Petryshen TL, Sabetti PC, Aldinger KA, et al. Population genetic study of the brain-derived neurotrophic factor (BDNF) gene. Mol Psychiatry 2010;15(8):810– 15. doi: 10.1038/ mp.2009.24.
20. Wiłkość M, Szałkowska A, Skibińska M, et al. BDNF gene polymorphisms and haplotypes in relation to cognitive performance in Polish healthy subjects. Acta Neurobiol Exp 2016;76:43– 52.
21. van den Heuvel L, Suliman S, Malan-Müller S, et al. Brain-derived neurotrophic factor (BDNF) Val66Met polymorphism and plasma levels in road tradic akcident survivors. Anxiety Stress Coping 2016;29(6):616-29. doi:10.1080/ 10615806.2016.1163545.
22. Chen SL, Lee SY, Chang YH, et al. The BDNF Val66Met polymorphism and plasma brain-derived neurotrophic factor levels in Han Chinese heroin-dependent patiens. Sci Rep 2015;5:8148. doi: 10.1038/ srep08148.
23. Colle R, Deflesselle E, Martin S, et al. BDNF/ TRKB/ P75NTR polymorphisms and their consequences on antidepressant efficacy in depressed patients. Pharmacogenomics 2015;16(9):997– 1013. doi: 10.2217/ pgs.15.56.
24. Nectoux J, Bahi-Buisson N, Guellec I, et al. The p.Val66Met polymorphism in the BDNF gene protects against early seizures in Rett syndrome. Neurology 2008;70(22):2145– 51. doi: 10.1212/ 01.wnl.0000304086.75913.b2.
Labels
Paediatric neurology Neurosurgery NeurologyArticle was published in
Czech and Slovak Neurology and Neurosurgery
2017 Issue 5
Most read in this issue
- Leberova hereditární neuropatie optiku
- Esenciální tremor – vzniká nový nozologický koncept?
- Statiny indukovaná nekrotizující autoimunitní myopatie
- Terapia pokročilých štádií Parkinsonovej choroby invazívnymi postupmi